Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-21P61565 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-21P61565 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms