Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE1P56817 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BACE1P56817 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BACE1P56817 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BACE1P56817 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BACE1P56817 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BACE1P56817 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BACE1P56817 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BACE1P56817 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BACE1P56817 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BACE1P56817 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BACE1P56817 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BACE1P56817 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BACE1P56817 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BACE1P56817 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BACE1P56817 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BACE1P56817 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BACE1P56817 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BACE1P56817 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BACE1P56817 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms