Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX10P56693 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX10P56693 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX10P56693 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX10P56693 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX10P56693 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX10P56693 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX10P56693 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX10P56693 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms