Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MANFP55145 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MANFP55145 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MANFP55145 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MANFP55145 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MANFP55145 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MANFP55145 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MANFP55145 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms