Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2A1P52655 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms