Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPFP49454 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPFP49454 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPFP49454 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPFP49454 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPFP49454 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPFP49454 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPFP49454 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPFP49454 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPFP49454 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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CENPFP49454 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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CENPFP49454 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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CENPFP49454 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPFP49454 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPFP49454 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPFP49454 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPFP49454 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPFP49454 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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CENPFP49454 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPFP49454 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPFP49454 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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CENPFP49454 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPFP49454 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPFP49454 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPFP49454 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPFP49454 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPFP49454 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPFP49454 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPFP49454 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPFP49454 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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