Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI2P48788 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms