Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAPZBP47756 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPZBP47756 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms