Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA6P31267 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms