Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA1P29973 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms