Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRBP28702 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRBP28702 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRBP28702 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRBP28702 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRBP28702 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRBP28702 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRBP28702 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRBP28702 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RXRBP28702 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRBP28702 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRBP28702 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRBP28702 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRBP28702 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRBP28702 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRBP28702 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRBP28702 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRBP28702 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RXRBP28702 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRBP28702 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRBP28702 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRBP28702 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRBP28702 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRBP28702 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRBP28702 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RXRBP28702 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RXRBP28702 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRBP28702 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRBP28702 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRBP28702 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRBP28702 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRBP28702 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRBP28702 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRBP28702 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRBP28702 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRBP28702 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRBP28702 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRBP28702 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRBP28702 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRBP28702 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRBP28702 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RXRBP28702 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RXRBP28702 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RXRBP28702 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RXRBP28702 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RXRBP28702 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms