Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2B4P23634 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms