Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRDP23468 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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