Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSPT1P15170 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms