Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP2C9P11712 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP2C9P11712 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms