Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOP2AP11388 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms