Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP1P11387 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP1P11387 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TOP1P11387 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TOP1P11387 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TOP1P11387 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TOP1P11387 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP1P11387 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP1P11387 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP1P11387 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms