Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLI3P10071 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLI3P10071 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLI3P10071 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLI3P10071 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLI3P10071 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLI3P10071 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLI3P10071 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLI3P10071 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLI3P10071 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GLI3P10071 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLI3P10071 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLI3P10071 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLI3P10071 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI3P10071 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLI3P10071 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms