Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD2P0DJD1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms