Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM2O94769 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM2O94769 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM2O94769 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM2O94769 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM2O94769 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM2O94769 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM2O94769 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM2O94769 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM2O94769 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM2O94769 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM2O94769 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms