Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN15O75808 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN15O75808 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms