Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSVO60911 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTSVO60911 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSVO60911 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSVO60911 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSVO60911 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSVO60911 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSVO60911 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSVO60911 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSVO60911 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms