Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPAG9O60271 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
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SPAG9O60271 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SPAG9O60271 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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