Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms