Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms