Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms