Protein–RNA interactions for Protein: A7E2V4

ZSWIM8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM8A7E2V4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZSWIM8A7E2V4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZSWIM8A7E2V4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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