Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms