Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEFA5A3E0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms