Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIPSLA2A3N6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms