Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms