Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TMIEQ8NEW7 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms