Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FXNQ16595 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FXNQ16595 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
FXNQ16595 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
FXNQ16595 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
FXNQ16595 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms