Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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