Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ASAH1-203ENST00000381733 2512 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 TRIM16-212ENST00000578237 3206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 U3.18-201ENST00000390880 216 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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