Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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BPTFQ12830 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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BPTFQ12830 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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BPTFQ12830 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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BPTFQ12830 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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BPTFQ12830 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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