Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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