Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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