Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PTPRBP23467 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PTPRBP23467 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PTPRBP23467 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PTPRBP23467 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PTPRBP23467 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PTPRBP23467 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PTPRBP23467 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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