Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LINC02217-203ENST00000508677 296 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 FABP5P7-201ENST00000524732 405 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AP001767.2-201ENST00000527291 382 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC025576.2-201ENST00000535806 390 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ARHGDIB-206ENST00000541546 859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC139085.1-201ENST00000582716 182 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 Metazoa_SRP.205-201ENST00000620071 267 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC006581.2-201ENST00000631830 455 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 Metazoa_SRP.211-201ENST00000635920 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 SPRR4-201ENST00000328051 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RNA5SP174-201ENST00000362702 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RN7SKP246-201ENST00000364553 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRAC1Q96KF2 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms