Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CCDC93Q567U6 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CCDC93Q567U6 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CCDC93Q567U6 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CCDC93Q567U6 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CCDC93Q567U6 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC93Q567U6 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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