Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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