Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
USF2Q15853 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
USF2Q15853 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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