Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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CDH18Q13634 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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CDH18Q13634 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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CDH18Q13634 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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