Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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SGCGQ13326 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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SGCGQ13326 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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