Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TRIM28Q13263 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms