Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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