Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PDE4DQ08499 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PDE4DQ08499 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PDE4DQ08499 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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