Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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PTPRMP28827 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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PTPRMP28827 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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