Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRGP23470 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms